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Naja, was erwartest du, du hast deine Festplatte quasi teilweise formatiert und das im laufenden Betrieb. Das ist, als würdest du den Motor ausbauen, während er läuft.

Normalerweise macht man das, indem man die Windows-CD ins Laufwerk legt, den Rechner neustartet und ihn von der CD starten lässt (Beim BIOS-Post Screen F10 drücken). Dann kommt das nette Windows-Setup und lässt dich bei Bedarf deine Platten formatieren und Windows neuinstallieren.
Ach ja, D: hättest du überhaupt nicht löschen müssen, die festplatte, auf der sich das Betreibssystem befinden reicht völlig aus.....